却桓温得专擅晋政，威权无比。他本来是目无君相，窥觎非分，曾经卧对亲僚道：“为尔寂寂，恐将为文景所笑！”
文景指司马师兄弟。嗣而又推枕起座道：“不能流芳百世，亦当遗臭万年！”为此一念，贻误不少。又曾经过王敦墓，慨望叹息道：“可人！可人！”
先是有人以王敦相比，桓温甚不平，至此反而感慨仰慕王敦，意图叛逆。
这个时候有远方女尼，前来面见桓温，桓温见她道骨珊珊，料非常人，于是留居别室。
那女尼在室中洗澡，桓温从门隙窥视，见女尼裸身入水，先自用刀破腹，继断两足，桓温大加惊异。既而女尼开门出来，完好如常，且已知桓温偷视己浴，竟问桓温道：“公可窥见否？”桓温料不可讳，便问主何吉凶？
女尼答云：“公若作子，亦将如是！”桓温不禁色变，女尼即而向桓温告别离去。术士杜炅，能知人贵贱；桓温令言自己禄秩，杜炅微笑道：“明公勋格宇宙，位极人臣。”桓温默然不答。若非此二人相诫，桓温已早为桓玄了。
他本欲立功河朔，收集时望，然后还受九锡。自枋头败归，声名一挫，及既克寿春，因语参军郗超道：“此次战胜，能雪前耻否？”
郗超答言尚未。既而郗超就在桓温宿舍，夜半时对桓温道：“明公当下重任，年垂六十，尚未建立大功，如何镇惬民望！”桓温乃向郗超求计，郗超道：“明公不为伊霍盛举，恐终不能宣威四海，压服兆民。”
桓温皱眉道：“此事将从何起？”
郗超附耳道：“这般这般，便不患无词了。”此贼可恶。桓温点首称善，方才安寝。
越日，便造出一种谣言，流播民间，但皇帝司马奕素有阳痿之疾，不能御女，嬖人朱灵宝等，参侍内寝，二美人田氏和孟氏，私生三男，将建立太子，潜移皇基云云。
这种暧昧的情词，从何证实？明明是无过可指，就把那床第虚谈，架诬给皇帝司马奕，这真所谓欲加之罪，何患无辞呢。
桓温既而故意将此谣言传出，遂自广陵来到建康，奏禀太后褚氏，请将皇帝司马奕废去，改立丞相会稽王司马昱，并将废立命令，拟就草稿，一并呈入。
适得褚太后在佛屋烧香，由内侍入启云：“外有急奏。”
褚太后走出，来到门前，已有人持入奏章，捧呈褚太后。褚太后倚户展阅，看了数行，便怅然道：“我原疑有此事。”疑司马奕耶？疑桓温耶？着，又另阅令草，才经一半，即索笔写入道：“未亡人不幸罹此百忧，感念存殁，心焉如割。”
写毕，便交与内侍，饬令送还。废立何事，乃草草批答，褚太后亦未免冒失。
桓温在外面待着，但恐太后不允，颇有忧容。及内侍颁还令草，无甚驳议，始改忧为喜。
越日，桓温来到朝堂，召集百官，取示令草，决议废立。
百官见状，都震栗失色，莫敢抗议；只是两晋相传，并没有废立故事，此次忽然提倡此议，欲要援证典章，苦无成制，百官都面面相觑，无从悬定。就是桓温亦是仓皇失措，不知所为。仓猝废立，典礼都未筹备，于是百官莫敢抗议，晋朝廷可谓无人。
独尚书仆射王彪之，毅然对桓温道：“公阿衡皇家，当参酌古今，何不追法先代？”
桓温喜语道：“王仆射确是多能，就烦裁定便了。”
王彪之即命取汉《霍光传》援古定制，须臾即成，乃朝服立阶，神采自若。逢迎权恶，装出什么仪态。
然后王彪之将太后的命令，宣示朝堂，道：“王室艰难，穆哀恶，国嗣不育，储宫靡立。琅琊王奕，亲则母弟，故以入纂大位。不图德之不建，乃至于斯！昏浊溃乱，动违礼度。有此三孽，莫知谁予。人伦道丧，丑声遐布。既不可以奉守社稷，敬承宗庙，且昏孽并大，便欲建树储藩，诬罔祖宗，倾移皇基，是而可忍，孰不可怀！
今废奕为东海王，以王还第，供卫之仪，皆如汉朝昌邑故事。但未亡人不幸罹此百忧，感念存殁，心焉如割。社稷大计，义不获已。丞相录尚书事会稽王昱，体自中宗，明德劭令，英秀玄虚，神契事外，以具瞻允塞，故阿衡三世，道化宣流，人望攸归，为日已久，宜从人之心，以统皇极。饬有司明依旧典，以时施校此令。”
总计皇帝司马奕在位六年，无什么失德之事，不过司马奕虽然在位，好似傀儡一般，内有会稽王司马昱，外有大司马桓温，把持国政。他曾经自虑失位，召术士扈谦筮易，卦象既成，扈谦据实答道：“晋室方如磐石，陛下未免出宫。”至是如今竟然如扈谦所言。
桓温使散骑侍郎刘享，收缴皇帝玺绶，逼司马奕出宫。时值仲秋，气尚暖，司马奕但着白帢单衣，步下西堂，乘犊车出神兽门，群臣相率拜辞，莫不欷歔。有何益处？侍御史殿中监，领兵百人，送司马奕至东海府第之郑一面具备法驾，由桓温率同百官，来到会稽邸第，迎会稽王司马昱入殿。
司马昱戴平巾帻，单衣东向，拜受玺绶，呜咽流涕。何必做作？当即入宫改着帝服，升殿受朝，即改太和六年为咸安元年，史家称他为晋简文帝。
桓温出次中堂，分兵屯卫，有诏因桓温有足疾，特命乘舆入朝。
桓温欲陈述废立本意，及引见时，但见晋简文帝泣下数行，倒也无词可，只好默然告退。
太宰武陵王司马曦，与晋简文帝是出同胞。晋简文帝即位，顾念本支，当然优礼相待。惟武陵王司马曦素好武事，又与殷浩之子殷涓，常相往来。
殷浩殁时，桓温遣人赍书前往吊唁，殷涓并不答谢，为桓温所恨，因并及太宰武陵王司马曦。新蔡王司马晃，乃是从前新蔡王司马腾之后裔，亦与桓温有隙。
还有广州刺史庾蕴，太宰长史庾倩，散骑常侍庾柔，皆为前车骑将军庾冰之子，就是废帝司马奕的皇后庾氏的弟兄。庾后既连带被废，降为东海王妃，桓温恐庾家族大宠多，暗中图划报复，于是想出一法，先扳倒武陵王司马曦，诬告他父子为恶，曾与袁真同谋叛逆，因此即免官归藩。
晋简文帝不得不从，出司马曦就第，罢司马曦之子司马综和他等官。桓温又迫令新蔡王司马晃，诬罪自首，连及武陵王司马曦父子，并殷涓、庾倩、庾柔等人，一同谋逆，且将太宰掾曹秀，舍人刘强，凭空加入，一股脑儿收付廷尉。
御史中丞谯王恬，即谯王承之孙。暗承桓温旨意，请依律诛杀武陵王怛。
晋简文帝复诏道：“悲惋惶怛，非所忍闻，应更详议。”
桓温复自上一表，固请诛曦，语近要挟，简文帝手书给桓温，内有晋祚未移，愿公奉行前诏；若大运已去，请避贤路云云。
桓温览到此诏，也不觉汗流色变，始奏废曦及三子家属，皆徙新安郡，免新蔡王司马晃为庶人，徙锢荥阳。殷涓、庾倩、庾柔、曹秀、刘强，一律族诛。
简文帝不便再驳，勉依桓温之议，可怜殷庾两大族，冤冤枉枉死了若干人。炎炎者灭，隆隆者绝。庾蕴在广州任内，闻难自尽，庾蕴长兄前为北中郎将庾希，季弟会稽王的参军庾邈，及庾希子攸之，并逃往海陵陂泽郑
独东阳太守庾友，也是庾蕴的兄长，因其子妇为桓温从女，特邀赦免。桓温自是气焰益盛，擅杀东海王司马奕三个儿子，及田氏孟氏二美人。旋复奏称东海公废黜，不可再临黎元，应依昌邑故事，筑第吴都。
晋简文帝商量诸多政治层面的事情，然后请褚太后下令，谓不忍废为庶人，可妥议徙封。
桓温复上奏可封司马奕为海西县侯，于是朝廷有诏徙封司马奕为海西县公。废后庾氏，积忧病殁，尚追贬为海西公夫人。会吴兴太守谢安，入为侍中，遥见桓温面色，便即下拜。桓温惊呼道：“安石。何故如此？”安石就是谢安的表字。
谢安答道：“君且拜前，臣难道敢揖后吗？”
桓温明知谢安有意嘲讽，但是自己素来看重谢安名望，不便发作，且默记前时女尼对自己的微言，也有戒心，因此即上书鸣谦，求归姑孰。
朝廷诏进桓温为丞相，令居京师辅政。桓温仍然固辞，乃许他还镇。
秦王苻坚听闻桓温行废立之事，顾语群臣道：“桓温之前败灞上，后败枋头，不知思愆自贬，遍谢百姓，反且废君逞恶，六十老人，作此举动，怎能为四海所容？古谚有云‘怒其室，作色于父’便是桓温的注脚呢。”
桓温虽然还镇，揽权如故。且留郗超为中书侍郎，名他为入值宫廷，实是隐探朝事。
晋简文帝格外拱默，尚恐桓温再有异图，此时，文师见荧惑星逆行进入太微星旁边，上报朝廷，晋简文帝越发感觉惊惶，原来皇帝司马奕被废以前，荧惑星曾经守太微端门，仅逾一月，即有废立大事。此番又经星文告变，哪得不危悚异常。晋简文帝当下召来郗超，问道：“命数修短，也不遑计，但观察文，得勿复有前日事么？”
郗超答道：“大司马温，方思内固社稷，外恢经略，非常事只可一为，何至再作？臣愿百口相保，幸陛下勿忧！”
晋简文帝道：“但得如此，尚有何言！”
郗超即告退。侍中谢安，曾经与左卫将军王坦之，来到郗超身边禀告事情，郗超门多车马，络绎不休，待至日旰，尚未得间。
王坦之欲离去，谢安秘密对他道：“君独不能为身家性命，忍耐须臾么？”
王坦之于是忍气待着，直至薄暮，才得与郗超清谈，言语毕就告别了。
郗超之父郗愔卸职家居，偶有不适，由郗超请假归省，晋简文帝与语道：“致意尊翁，家国事乃竟如此，自愧不德，负疚良深，非一二语所能尽意。”
至此，因而咏昔人诗云：“志士痛朝危，忠臣哀主辱。”二语本庾阐诗。咏罢泣下，郗超无言可对，拜别而去。好容易过了残年，复遣王坦之征桓温入宫辅佐，桓温复固辞，惟与王坦之言及，请将海西公外徙。
王坦之返报，乃徙海西公至吴县西柴里。敕吴国内史刁彝，就近防卫，并遣御史顾允，监督起居，免有他变。
蓦然听闻庾希和庾邈，联结故青州刺史武子沈遵，聚众海滨，掠得鱼船，夤夜突入京口城。晋陵太守卞耽，猝不及防，逾城奔曲阿，于是建康震惊，内外戒严。嗣又得庾希等檄文，托称受海西公密旨，起诛首恶桓温，累得京畿一带，讹言蜂起，益相惊扰。
平北参军刘奭，高平太守郗逸之，游军督护郭龙等，引兵往击，就是卞耽，亦调发县兵，一并讨发庾希等人。
希众统是乌合，一战即败，闭城自守，再由桓温遣到东海太守周少孙，也有锐骑数千，合力攻城，攀堞杀入。庾希兄弟子侄，以及沈遵等人，没处逃奔，遂致陆续被擒，送到建康市中，伏诛了案。一番乱事，数日即平，晋廷诸臣，入朝庆贺，又像是化日光。冷隽之语。
哪知吉凶并至，悲喜相寻，晋简文帝忽然得病，医治罔效，差不多将要归。当时皇后太子，俱尚未立，将起来，又须溯述源流，表明颠末。
晋简文帝为晋元帝之少子，生母郑氏，受封建平国夫人，咸和元年病殁。晋简文帝受封主爵，追号郑氏为会稽太妃，嗣位后时日尚浅，故未及追尊。
惟晋简文帝先娶王氏，生子司马道，生为世子，后来母子并失帝意，俱被幽废，王氏忧郁成疾，亦即去世，此外妾媵颇多，生有三个男孩，又皆夭逝。
未几，司马道生又亡，晋简文帝年垂四十，迭丧诸子，未免悲悼，况膝下竟致无男，诸姬偏皆绝孕，不由的寸心焦灼，百感旁徨。
这个时候，晋简文帝听闻术士扈谦，善能卜易，因召令入筮。扈谦占筮完毕，然后作答道：“后房中已有一女，当生二贵男，长男尤贵，当兴晋室。”
晋简文帝乃转忧为喜，但麒麟佳种，究未识属诸谁人，适得徐贵人生下一女，眉目韶秀，酷肖生母。徐氏本以秀慧见幸，既得破胎，总望她接连有娠，得产麟儿。谁料一索再索，音响寂然。
晋简文帝却年齿日增，望子愈切，不得已访求相士，得一叔服后人，叔服乃是周时内史，具相人术。令他入宫视察诸位姬妾，能否生男孩？
偏偏他接连摇首，无一许可。于是再将婢媵等一齐出示，仍未称善。最后看到一个织布的婢女，身长色黑，仿佛似乡僻女子一般，不禁惊诧道：“这才算是贵相，必生贵模”别具只眼。
那些宫人听了这话，都葫芦大笑道：“昆仑婢要发迹了！日前的好梦，才得实验了！”
晋简文帝叱道：“何故罗唣？”大众始不敢再言，嗣经简文帝问明底细，始知此婢女姓李，名叫陵容，家世寒微，入充织坊女工。旁人因她形体壮硕，皮肤黝黑，头发卷曲，替她取一绰号，叫做昆仑婢。（有没有可能这个李陵容可是有东南亚或者印度黑饶血统？）
她曾经梦见有两龙枕膝，日月入怀，便欣然称为吉兆，屡次与同侪及。同侪相率揶揄，不是她要做皇后，就是她要做皇娘。
偏偏弄假成真，变虚为实，晋简文帝竟令她侍寝，一度春风，遽结珠胎，十月分娩，居然是一雄。临盆以前，李氏复梦一神人，送给一儿，且嘱咐道：“此儿畀汝，可取名昌明。”
李氏向神接受，忽然感觉一阵腹痛，遂致惊醒，当下起床坐蓐，立即产出一儿，呱呱坠地。
时值黎明，李氏记受神嘱，使侍女转启晋简文帝，呼婴儿字为昌明。晋简文帝闻报，谓既得诸神授，当然不宜更换，惟以昌明为字，即将昌明二字的寓意，取名为曜，后来晋简文帝猛记前事，曾见一谶文云：“晋祚尽昌明！”
不觉流涕道：“数数，只好听由命罢！”
看到后文，又觉似是而非。既而李氏又生一男一女，男名司马道子，后得封王专政，女长成后，至昌明嗣位，封为鄱阳长公主，这且再表。
且晋简文帝寝疾经旬，渐至弥留，于是立皇子司马昌明为太子，并封司马道之子为琅琊王，领会稽内史，使奉帝母郑太妃祀，又召大司马桓温入宫协辅，一日一夜，连发四诏，未见桓温来到。
此番架子却摆错了！于是命人草就遗诏，使大司马温依周公居摄故事，且谓少子可辅最佳，如不可辅，卿可自取。
这草诏颁将出去，被王坦之接着。王坦之已迁官侍中，看了草诏，便即趋入，直抵简文帝榻前，把草诏撕作数片。
晋简文帝瞧着，已知坦之用意，便顾语道：“下系傥来物，卿有何嫌！”
王坦之道：“下乃宣帝元帝的下，陛下怎得私相授受呢！”
皇帝乃使坦之改诏道：“家国事一禀大司马，如诸葛武侯王丞相指王导。故事。”坦之改就，乃持诏而出。是夕，简文帝崩，年五十有三，在位实不满一年。只因过一元旦，两个半年，算做两年。
群臣会集朝堂，未敢立嗣，互相私议，或谓须归大司马处分。尚书仆射王彪之正色道：“子崩，太子代立，这乃古今通例，大司马何致异言？若先面咨，恐反为所责了。”
朝议乃定，遂奉太子司马昌明嗣即帝位，颁诏大赦，是为晋孝武帝，孝武帝司马曜年尚只有十岁，褚太后以冲人践阼，并居谅闇，不如使桓温依周公居摄故事，令照前议施校
王彪之又进言道：“这乃异常大事，大司马必当固让，恐转使万机倍滞，稽废山陵，臣等未敢奉令，谨即封还！”
于是此建议遂不校桓温颇望晋简文临终，召已禅位，否则或使居摄，不意遗诏颁到，大失所望，乃写信给弟弟桓冲，书中道：“遗诏但使我依武侯王公故事呢。”一语已写尽怨望。
是年十月，彭城妖人卢悚，自称大道祭酒，煽惑愚民八百余家，因遣徒许龙如吴，驰入海西公门，诈传太后密诏，奉迎兴复。
海西公司马奕，几乎为他们所惑，幸保母在旁谏阻，始拒却许龙之请。许龙愤然道：“大事垂成，奈何听信儿女之言！”
司马奕答道：“我得罪居此，幸蒙宽宥，怎敢妄动？且太后有诏，应使官属来迎，汝系何人，乃敢妄来传旨呢？”一经明，其假立见，然非保母提醒，几乎就是去送死了。许龙尚不肯行，当由司马奕叱令左右，上前准备捆缚许龙，尤始仓皇遁去。
是时，宫廷方料理丧葬，奉安葬晋简文皇帝于高平陵，庙号太宗。葬事才毕，忽然有乱徒，突然闯入云龙门，诈称海西公回都，直达殿廷，略取武库甲仗，卫士骇愕，不知所为，亏得游击将军毛安之，听闻事变立刻进入云龙门，引着部曲士兵，奋击乱党。
又有左卫将军殷康，中领军桓秘，从止车门驰入，也有部众数百人，与毛安之并力夹击，乱党不过三四百名，哪里敌得过猛将三员，虎旅千余，顿时死的死，逃的逃，那头目也情急欲遁，被毛安之截住厮杀，不到十合，已将他打倒地上，用绳捆住。讯明姓名，便是妖贼卢悚，当即按律拟罪，伏法市曹。
海西公曾拒绝乱徒，得免连坐，但经此一吓，越觉心，索性杜聪塞明，无思无虑，有时借酒消遣，有时对色陶情，时人怜他无辜遭废，为作哀歌。司马奕却屏去一切，得过且过，直至太元十一年冬，安然病逝，享年四十有五。有诗叹道：
废主由来少善终，居吴幸免海西公。
心似为冤诬惜，不使孱王剑血红！
越年，改元宁康。大司马桓温，竟自姑孰入朝，都中复大起讹言，恼惧的了不得。究竟有无祸事，俟至下回明。
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