然而，就在大家以为一切都归于平静之时，艾利克斯却时常感到不安。一夜里，他独自来到曾经放置结构体的地方，竟发现结构体再次发出微弱的异动。他赶紧通知卡修。众人赶来，一番检测后发现，虽然宇宙规则暂时稳定，但那次的修复触动了更深层次的平衡。
卡修意识到事情还没彻底解决，决定重新召集各星球精英组成探索队深入结构体内部探究。艾利克斯自然首当其冲。进入结构体核心区域后，他们遭遇了一系列奇异的空间扭曲现象。艾利克斯依靠感知力引导大家前行，最后发现一个巨大的能量漩危正当大家疑惑时，漩涡中传出声音，表示这是宇宙自我调整的一部分，如果强行干涉，将会引发更大灾难。
卡修与艾利克斯权衡利弊后，选择相信宇宙自身的力量，带领众人退出结构体。离开后，他们密切关注结构体动态，同时制定计划以应对可能到来的新变化。
数周过去，结构体看似平静下来。但艾利克斯心中的不安并未消散。一，他们收到来自遥远星系的求救信号，信号显示那里也出现了类似结构体造成的空间紊乱现象。卡修决定派遣部分队员前去探查，艾利克斯主动请缨。到达求救地点后，他们发现这里的空间扭曲比之前遇到的更为复杂。艾利克斯尝试用感知力寻找根源，却受到一股强大力量的干扰。就在大家一筹莫展之际，艾利克斯突然发现周围的环境似曾相识，像是结构体内部能量漩涡周边的景象。这时，他推测或许结构体并非唯一的危机源，背后存在着某种连锁反应机制。于是，他将想法告知队友并提出先回基地研究之前结构体的数据，再找出应对方法。众人表示赞同，随后撤离这片危险区域返回基地，准备迎接即将面临的巨大挑战。
回到基地后，艾利克斯一头扎进数据之郑经过日夜钻研，他发现所有异常空间现象中的能量波动有着微妙联系，就像一张隐藏的大网。而之前结构体中的能量漩涡只是其中一个节点。
卡修组织起团队会议，艾利克斯向众人展示成果。他们意识到必须找到这张大网的中心才能真正解决危机。
通过分析众多求救信号的来源坐标，艾利克斯推算出可能的中心位置——神秘的暗星领域。这是一片充满未知危险的死寂之地。
尽管危险重重，他们还是组建探险队前往。抵达暗星领域边缘时，飞船就遭受莫名攻击。艾利克斯等人不得不冒险冲出飞船。
在这里，空间完全错乱，时间也仿佛失去意义。艾利克斯凭借超强感知力艰难前行，终于找到了疑似源头——一颗散发幽光的黑色晶体。当他们靠近晶体时，一股强大吸力传来。就在众人要被吸入之时，艾利克斯激发全身能量抵抗，成功阻止了吸力。此时，艾利克斯知道，他们离真相已经很近了。
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